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摘要:
采用RACE技术首次克隆太平洋真宽水蚤CYP4C和CYP44全长cDNA序列,并命名为EpCYP4C和Ep-CYP44.EpCYP4C基因全长序列2 032 bp,5'非翻译区60 bp,3'非翻译区487 bp,开放阅读框1 485 bp,编码494个氨基酸;EpCYP44全长cDNA序列1 752 bp,开放阅读框1 485 bp,编码494个氨基酸,5'非翻译区85 bp,3'非翻译区182 bp.经预测发现EpCYP4C和EpCYP44蛋白具有CYP450家族蛋白特有的血红素结合区FxxGxxxCxG;而且EpCYp4C蛋白具有CYP4家族基因特征序列EVDTFMFEGHDTT.通过多序列比对和系统进化树分析发现EpCYP4C和EpCYP44蛋白与近亲真宽水蚤同源性更高,亲缘关系更近.蛋白二级结构预测显示EpCYP4C和EpCYP44蛋白主要以α螺旋和无规则卷曲为主.亚细胞定位预测发现EpCYP4C和EpCYP44蛋白分布在细胞质和线粒体的可能性较大,这可能与CYP450酶系的解毒代谢机制相关.研究结果说明太平洋真宽水蚤EpCYP4C和EpCYP44基因均为CYP450酶系,且太平洋真宽水蚤EpCYP4C基因属于CYP4家族.对太平洋真宽水蚤EpCYP4C和EpCYP44基因的序列分析为进一步研究EpCYP4C和EpCYP44基因在污染物暴露下的表达奠定理论基础;同时有助于了解海洋桡足类CYP450超家族的分子特征.
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文献信息
篇名 太平洋真宽水蚤CYP4C和CYP44基因克隆及分子特征分析
来源期刊 浙江海洋大学学报(自然科学版) 学科 农学
关键词 太平洋真宽水蚤 CYP4C CYP44 RACE 基因克隆 序列分析
年,卷(期) 2020,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 9-18
页数 10页 分类号 S917.4
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王斌 33 330 8.0 18.0
2 张建设 3 0 0.0 0.0
3 周真真 1 0 0.0 0.0
4 曾善美 1 0 0.0 0.0
5 景斐 1 0 0.0 0.0
6 夏立萍 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
太平洋真宽水蚤
CYP4C
CYP44
RACE
基因克隆
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
浙江海洋大学学报(自然科学版)
双月刊
2096-4730
33-1404/P
大16开
浙江省舟山市
1982
chi
出版文献量(篇)
2175
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