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基于TCGA数据库分析DLX3基因在结肠癌组织中的表达与临床价值
基于TCGA数据库分析DLX3基因在结肠癌组织中的表达与临床价值
作者:
向晓辉
李海
毛骏
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
结肠癌
远端缺失同源盒3
生物信息学
临床价值
摘要:
[目的]研究远端缺失同源盒3 (distal-less homeobox 3,DLX3)基因在结肠癌中的表达情况,探讨DLX3在癌症产生与进展过程中起到的作用和临床意义.[方法]利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)得到结肠癌公共数据集,获取DLX3 mRNA表达谱和患者相关的临床信息.利用相关生物信息学方法,分析DLX3在结肠癌中的表达量与临床病理指标的相关性以及对预后的影响.用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测DLX3在结肠癌中调控的可能通路.[结果]由TCGA数据库结肠癌数据集分析可得,DLX3在肿瘤组织中呈高表达,表达量与年龄、TNM分期和肿瘤有无转移显著相关(P<0.05).DLX3高表达的患者总体生存期明显低于DLX3低表达的患者(P<0.05).多因素COX回归分析提示DLX3的表达水平、年龄及TNM分期是影响结肠癌患者总体生存期的独立危险因素(P<0.05).DLX3高表达的样本存在Wnt/β-catenin 和Kras两个通路基因集的富集(P<0.05,FDR<0.25).[结论]DLX3可能在结肠癌的发生发展过程中起到重要作用,具备成为判断结肠癌预后和潜在治疗靶点的临床应用前景.
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篇名
基于TCGA数据库分析DLX3基因在结肠癌组织中的表达与临床价值
来源期刊
武警后勤学院学报(医学版)
学科
医学
关键词
结肠癌
远端缺失同源盒3
生物信息学
临床价值
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
36-40
页数
5页
分类号
R735.3
字数
语种
中文
DOI
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姓名
单位
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李海
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结肠癌
远端缺失同源盒3
生物信息学
临床价值
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
武警后勤学院学报(医学版)
主办单位:
武警后勤学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-3720
CN:
12-1294/R
开本:
大16开
出版地:
天津市东丽区成林道222号
邮发代号:
创刊时间:
1995
语种:
chi
出版文献量(篇)
6139
总下载数(次)
7
总被引数(次)
16970
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