感染二分浓核病毒家蚕相关MicroRNA的筛选与鉴定

• 作者: 侯成香 李斌 杨娟 汪羚 郭锡杰 陈润浈 高坤
• 来源期刊: 蚕业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 家蚕 MicroRNA 二分浓核病毒
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 161-170
• 页数: 10页
• 分类号: S884.5|Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13441/j.cnki.cykx.2020.02.005

摘要

二分浓核病毒(bidensovirus,BDV)是家蚕病毒病的主要病原之一.为了筛选和鉴定家蚕体内与BDV感染相关的差异表达microRNA (miRNA),对家蚕品种JS的3龄起蚕添食BDV,36 h后收集家蚕并提取总RNA,采用高通量测序技术分析家蚕感染BDV后应答的miRNA,从中筛选出24个显著差异表达的miRNA,其中14个为已知miRNA,10个为新发现的miRNA.进一步利用反转录PCR(RT-PCR)技术对上述24个miRNA进行验证,发现这些miRNA均在家蚕幼虫体内表达;利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测家蚕感染BDV后这些miRNA的表达情况,发现其中9个miRNA表达上调,15个miRNA表达下调,其中表达上调倍数最高的为bmo-miR-1923,相对表达上调了8.87倍,表达下调倍数最高的为bmo-miR-13b-3p,相对表达下调了6.97倍.此外,根据测序结果进行生物信息学预测和分析差异表达miRNA的靶基因,并利用GO分析对靶基因进行功能分类,发现这些靶基因主要参与了细胞过程、催化、结合和代谢过程.研究结果将为阐明家蚕抗BDV的分子机制提供数据参考和技术支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭锡杰		43	155	7.0	10.0
2	高坤		43	163	9.0	11.0
3	侯成香		14	71	3.0	8.0
4	杨娟		2	0	0.0	0.0
5	汪羚		3	2	1.0	1.0
6	李斌		4	1	1.0	1.0
7	陈润浈		1	0	0.0	0.0