猪A型塞内卡病毒感染诱导猪肾细胞(PK-15)长链非编码RNA差异表达谱的分析

• 作者: 吴芮庭 周芝海 唐晓钰 苏江南 郑瑶瑶 陈雨琪 马静云
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 长链非编码RNA 塞内卡病毒 信号通路 转录组测序
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 6-11
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 4033字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.201904039

摘要

为研究猪A型塞内卡病毒(SVA)感染猪肾细胞(PK-15)后对于PK-15 lncRNA表达谱的影响,本研究进行了高通量测序以检测SVA感染诱导PK-15产生的差异表达lncRNA.结果 显示,在SVA感染后24h,共诱导1 043个IncRNA差异表达,其中已知的lncRNA 420个,未知的lncRNA 623个.GO富集和KEGG通路分析显示,lncRNA靶基因富集于p53信号通路、RIG-Ⅰ样受体信号通路、MAPK信号通路、IgA生成的肠道免疫网络通路等.根据高通量测序结果选择了8个差异表达的lncRNA采用荧光定量PCR验证,验证结果与高通量测序结果一致.本研究初步表明lncRNA参与了SVA对PK-15细胞的感染过程,为SVA的分子机制研究提供了新的方向.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马静云	华南农业大学动物科学学院	87	548	13.0	19.0
2	吴芮庭	华南农业大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0
3	周芝海	华南农业大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0
4	郑瑶瑶	华南农业大学动物科学学院	2	0	0.0	0.0
5	唐晓钰	华南农业大学动物科学学院	1	0	0.0	0.0
6	陈雨琪	华南农业大学动物科学学院	1	0	0.0	0.0
7	苏江南	华南农业大学动物科学学院	1	0	0.0	0.0