乙型脑炎病毒感染猪睾丸细胞的miRNA表达谱差异分析

• 作者: 乔绪稳 于晓明 侯立婷 侯继波 张元鹏 李兰 杜露平 杨利 杨占娜 郑其升 陈瑾
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 乙型脑炎病毒 猪睾丸细胞 miRNA 高通量测序
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 734-739
• 页数: 6页
• 分类号: S855.3
• 字数: 3981字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201812012

摘要

[目的]本试验旨在分析乙型脑炎病毒(JEV)感染猪睾丸(ST)细胞和正常ST细胞miRNA差异表达谱,以探索miRNA在JEV感染过程中的作用及其调控机制.[方法]分别提取正常ST细胞和JEV感染8 h后的ST细胞总RNA,利用高通量测序技术检测分析ST细胞中的miRNA表达谱并进行差异分析.使用miRanda软件对表达差异显著miRNA的靶基因进行预测并对靶基因进行GO分析.选取6个显著性差异表达的miRNA通过RT-qPCR进行验证.[结果]与正常ST细胞相比,JEV感染后的ST细胞有112个差异表达miRNA,其中80个miRNA上调表达,32个miRNA下调表达.经RT-qPCR方法验证6个差异表达的miRNA结果与高通量测序结果一致.差异表达miRNA靶基因的生物学功能相对集中在细胞代谢、细胞黏附等生物过程.[结论]检测和分析JEV感染后猪睾丸细胞的miRNA表达谱,获得了大量的与JEV感染相关的miRNA表达谱数据,为揭示JEV感染生殖系统致病机制提供了有效的数据和理论基础.