千里光苯丙氨酸解氨酶基因克隆与系统进化分析

• 作者: 刘朝波 左青青 张俊 李林 谢欣 钱刚 陈立
• 来源期刊: 遵义医科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 千里光 生物信息学分析 苯丙氨酸裂解酶(PAL) 进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 305-309
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3493字
• 语种: 中文

摘要

目的 对具有良好抗菌性的千里光进行pal基因克隆,进行序列结构与系统进化分析,揭示该酶生物学功能与进化地位.方法 以千里光转录组数据库中分离得到pal基因核酸序列设计引物,PCR扩增全长验证,运用SignalP、MEGA等系列生物信息学软件进行核酸序列信息、氨基酸结构特征与系统进化分析.结果 克隆获得长度为2159 bp的核酸序列,ORF分析表明该基因编码708个氨基酸,无信号肽,是非跨膜蛋白.与近缘物种pal基因blast分析表明其氨基酸序列与黑心菊、雪莲等相似度达92.22％,具有相同的活性位点和保守结构域.系统进化树分析表明,千里光与菊科植物青蒿、雪莲归于一个亚支,表明3种植物pal在进化上具有较近的亲缘关系.结论 千里光pal基因序列结构与其他14种PAL酶家族成员相似度高,在进化上与菊科植物较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李林	遵义医科大学基础医学院细胞生物学教研室	5	0	0.0	0.0
2	左青青	遵义医科大学基础医学院细胞生物学教研室	3	0	0.0	0.0
3	谢欣	遵义医科大学基础医学院细胞生物学教研室	1	0	0.0	0.0
4	刘朝波	遵义医科大学基础医学院细胞生物学教研室	1	0	0.0	0.0
5	陈立	遵义医科大学第一临床学院	1	0	0.0	0.0
6	张俊	遵义医科大学第一临床学院	1	0	0.0	0.0