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基于网络药理学联合GEO芯片分析干姜黄芩黄连人参汤治疗2型糖尿病的机理和分子靶点
基于网络药理学联合GEO芯片分析干姜黄芩黄连人参汤治疗2型糖尿病的机理和分子靶点
作者:
吴汶丰
张泽鑫
徐笋晶
方舒涵
谢丹
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
网络药理学
GEO芯片
干姜黄芩黄连人参汤
2型糖尿病
摘要:
目的 基于网络药理学联合GEO芯片差异基因分析的方法 ,分析干姜黄芩黄连人参汤治疗2型糖尿病的机理和分子靶点.方法 在TCMSP和Drugbank数据库检索相关药物信息,限定物种为"Homo sapiens",获得干姜黄芩黄连人参汤的活性成分和分子靶点.在GEO数据库检索疾病"Type 2 diabetes",通过分析与筛选,获取GSE29221芯片数据,使用R软件获取其差异基因,绘制热图和火山图.通过cytoscape3.7.2构建干姜黄芩黄连人参汤与2型糖尿病差异基因分子靶点图,使用Bisogenet和CytoNCA绘制核心靶点拓扑网络,并进行药物与疾病基因的GO(BP、CC、MF)和KEGG分析.结果 获得干姜黄芩黄连人参汤治疗2型糖尿病的49个活性成分,其治疗2型糖尿病的主要成分为槲皮素(quercetin)、黄芩素(wogonin)、山奈酚(kaempferol),以及与GEO共有差异基因55个,将差异基因进行PPI拓扑网络构建,筛选出候选基因8个,与KEGG通路富集基因合并,得到治疗2型糖尿病主要的9个基因为ERBB2、AKT1、EGF、PARP1、CDK2、EIF6、AHSA1、CAV1、HSPB1.GO生物过程731条,细胞成分31个,分子功能48个,主要涉及response to steroid hormone生物过程、cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex细胞成分,steroid hormone receptor activity分子功能等.KEGG通路11条,主要涉及HIF-1信号通路等.结论 研究提供了干姜黄芩黄连人参汤在治疗2型糖尿病重要的分子靶标和机理,为其临床与实验应用提供基础.
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文献信息
篇名
基于网络药理学联合GEO芯片分析干姜黄芩黄连人参汤治疗2型糖尿病的机理和分子靶点
来源期刊
广东药科大学学报
学科
医学
关键词
网络药理学
GEO芯片
干姜黄芩黄连人参汤
2型糖尿病
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
药理学
研究方向
页码范围
361-368
页数
8页
分类号
R285.5
字数
4794字
语种
中文
DOI
10.16809/j.cnki.2096-3653.2020022602
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
谢丹
广州中医药大学第二临床医学院
43
170
6.0
11.0
2
徐笋晶
广州中医药大学第一附属医院伤寒教研室
22
78
5.0
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3
张泽鑫
广州中医药大学第二临床医学院
11
14
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4
吴汶丰
广州中医药大学第二临床医学院
5
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方舒涵
广州中医药大学第二临床医学院
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干姜黄芩黄连人参汤
2型糖尿病
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东药科大学学报
主办单位:
广东药科大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1006-8783
CN:
44-1733/R
开本:
大16开
出版地:
广州市大学城外环东路280号
邮发代号:
46-148
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
4484
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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