nanoLC-MS/MS检测未成熟树突状细胞与其外泌体蛋白组分差异的初步研究

• 作者: 刘兴 屈梦珂 张凌 张志荣 李炎 林箐
• 来源期刊: 四川大学学报（医学版）
• 关键词: nanoLC-MS/MS 树突状细胞 外泌体 蛋白组分 FASP酶解法 SQUEST
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 81-86
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.12182/20200160103

摘要

目的 采用一种相对快速、样品需求量少的纳升级液相色谱串联质谱(nanoLC-MS/MS)法初步探究未成熟树突状细胞DC2.4及其来源的外泌体(DC-Exo)蛋白组分差异.方法 收集DC2.4细胞培养基上清,采用梯度离心法分离DC-Exo,使用蔗糖密度梯度超速离心进一步纯化而获得DC-Exo测定样品.采用Bradford法测定其蛋白总量,使用动态光散射法和透射电镜分别对DC-Exo粒度分布和形态进行考察.采用FASP酶解法制备DC2.4细胞和DC-Exo待测蛋白样品.nanoLC-MS/MS检测待测样品:采用μLPickUp上样模式,上样量仅1μg,Transport liquid及Micro A相均为0.05％三氟乙酸-2％乙腈(V/V)aq.;nanoLC使用Acclaim(R) PepMap RSLC分析柱,流动相为(A)0.1％甲酸水溶液(V/V)和(B)0.08％甲酸-80％乙腈(V/V),采用梯度洗脱,流速为0.3μL/min;MS/MS采用LTQ Obitrap双重质谱,使用APCI nanospray离子源,“一拖十”数据采集模式.得到结果以Uniport Mouse (Fasta文件)为蛋白数据库,采用SQUEST对DC2.4细胞及DC-Exo蛋白质谱信息进行搜索和匹配,并整理分析.结果 得到产量较高、粒径为40～200 nm的DC-Exo.用FASP酶解法处理得到的DC2.4细胞和DC-Exo冻干蛋白样品复溶后可直接上样,且上样量仅需1μg.搜库结果显示,DC2.4细胞含蛋白998种,其中高表达227种,特有蛋白535种;DC-Exo仅含蛋白348种,其中特有高表达18种;两者共有蛋白为306种,共有高表达蛋白7种.结论 本实验采用的nanoLC-MS/MS法所需进样量少,可相对快速地初步检测DC2.4细胞及其外泌体的蛋白组分差异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张志荣	四川大学华西药学院	236	2536	28.0	38.0
2	张凌	四川大学高分子科学与工程学院	91	489	12.0	18.0
3	李炎		18	74	4.0	8.0
4	林箐	四川大学华西药学院	4	13	3.0	3.0
5	屈梦珂	四川大学华西药学院	1	0	0.0	0.0
6	刘兴	四川大学华西药学院	6	22	4.0	4.0