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干旱胁迫和复水处理下玉米差异表达转录因子基因分析
干旱胁迫和复水处理下玉米差异表达转录因子基因分析
作者:
卫丽
库丽霞
张鹏钰
曹丽茹
王同朝
王国瑞
袁珍
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
玉米
干旱胁迫
复水
转录组
转录因子(TF)
摘要:
干旱是影响作物高产稳产的主要限制性因素,转录因子(transcription factor,TF)在植物对干旱胁迫的响应中起着至关重要的作用.本研究利用20%PEG6000在玉米(Zea mays)苗期模拟干旱胁迫处理60、96 h和复水3 d时,利用转录组测序(RNA-sequence,RNA-seq)技术,对转录因子基因的表达变化进行分析.结果显示,转录组测序总共检测到56类转录因子家族,共计2270个转录因子基因,差异表达的转录因子基因有556个,占总数的24.49%.与对照相比,干旱胁迫处理96 h,差异表达转录因子基因数目最少;复水3d时,差异表达转录因子基因数目最多,且主要呈现下调表达趋势.差异表达转录因子基因数目较多的家族有碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)、C2H2、乙烯反应元件结合蛋白(ethylene responsive factor,ERF)、禽成髓细胞性白血病病毒癌基因同源物(v-avian myeloblastosis viral oncogene homolog,MYB)、NAC和WRKY.由差异表达转录因子基因维恩图分析可知,共有37个转录因子基因在干旱胁迫及复水处理3个时间点均差异表达,分布于15个转录因子家族,其中WRKY家族数目最多.本研究结果可为进一步探讨玉米对旱胁迫转录因子家族的分子响应机制提供理论依据.
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干旱胁迫下割手密基因cDNA-SCoT差异表达分析
割手密
cDNA-SCoT
转录衍生片段(TDFs)
基因
干旱胁迫
干旱胁迫下花生差异表达转录因子家族分析
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干旱胁迫
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文献信息
篇名
干旱胁迫和复水处理下玉米差异表达转录因子基因分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
玉米
干旱胁迫
复水
转录组
转录因子(TF)
年,卷(期)
2020,(2)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
211-222
页数
12页
分类号
S513
字数
6981字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2020.02.003
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
40364
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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