花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析

• 作者: 姚玉荣 王万立 贲海燕 郝永娟 霍建飞
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 花椰菜 黑腐病 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术·遗传育种·种质资源
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S635.301
• 字数: 3949字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2020.07.001

摘要

为研究花椰菜抗黑腐病的分子机制,本试验利用Illumina测序平台的RNA-Seq技术对花椰菜黑腐病感病品种Y1-2和抗病品种EC-247接种黑腐病菌5 d后的样本进行高通量转录组分析,采用RSEM软件计算基因表达量,并在此基础上筛选两组样本间的差异表达基因.结果显示,抗、感品种间差异表达基因共3195个,其中上调表达基因1424个,下调表达基因1771个.通过GO和KEGG进行基因功能显著性富集分析发现,差异表达基因主要富集于苯丙烷类代谢、次级代谢产物合成、逆境响应、MAPK信号通路等途径.本研究结果可为解析花椰菜与黑腐病互作机制、挖掘黑腐病抗病基因提供参考.