黄芪多糖对C3H10T1/2细胞棕色脂肪分化中长链非编码RNA表达谱的影响

• 作者: 张世和 曹宇鑫 赵俊星 邓步皓 高旭阳
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄芪多糖 lncRNAs C3H10T1/2 棕色脂肪分化 表达谱
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 333-343,351
• 页数: 12页
• 分类号: S813.3
• 字数: 8235字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2020.04.007

摘要

本试验旨在探究黄芪多糖(APS)对小鼠间充质干细胞C3H10T1/2细胞棕色脂肪化过程中长链非编码RNA(lncRNA)表达谱的影响.试验以C3H10T1/2细胞为研究对象,在成脂诱导分化培养液中添加0.4 g/L的APS,以诱导分化1.5 d的细胞构建文库后测序,筛选差异mRNAs和差异lncRNAs,并对差异mRNAs和差异lncRNAs的顺式及共表达作用预测的靶基因进行了功能分析.通过荧光定量PCR随机分析了3个lncRNAs和3个mRNAs的表达水平,验证了测序结果的准确性.研究结果表明,本次测序共得到13450个lncRNAs和57776个mRNAs.通过对其表达量、长度、外显子个数和成对重复性检验分析证明了测序数据的可靠性较好.筛选共得到153个差异表达的lncRNAs和1238个差异表达的mRNAs.结果表明,差异mRNAs主要基因本体(GO)注释富集在53个功能分类中,京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析富集在343条通路中.差异lncRNAs顺式及共表达作用预测的靶基因GO注释分别富集在34和33个功能分类中,在分子功能中条目一致.KEGG分析显示,多个基因富集在脂肪代谢和脂肪分化的信号通路中,尤其在胰高血糖素及cAMP信号通路中富集显著.综上表明,APS导致了C3H10T1/2细胞成脂分化中lncRNA表达谱的变化.本研究结果可为进一步解析APS对干细胞的分化调节提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵俊星	山西农业大学动物科技学院	28	164	9.0	11.0
2	张世和	山西农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
3	曹宇鑫	山西农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
4	邓步皓	山西农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
5	高旭阳	山西农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0