尿路致病性大肠埃希菌的耐药和毒力全基因组分析

• 作者: 于爱萍 吕莉琨 张维 李晓燕 杨东靖 王源 苏旭
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 尿路致病性大肠埃希菌 多位点序列分型 耐药性 毒力 全基因组
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 269-275
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112309-20190722-00222

摘要

目的 从基因组水平上探讨尿路致病性大肠埃希菌UPEC132株的耐药性和致病机制.方法 采用MIC法测定菌株UPEC132对16种抗菌药物的敏感性,多位点序列分型(MLST)方法对其分型,利用三代测序平台对其进行全基因组测序和组装,并用Prodigal软件预测和数据库筛选进行耐药和毒力基因功能注释,然后收集GenBank上23株UPEC菌株的染色体基因组序列,利用RAxML软件对UPEC132进行系统进化分析并构建系统进化树.结果 UPEC132菌株对氨苄青霉素、氨苄青霉素/舒巴坦、四环素、红霉素、氯霉素、头孢唑林耐药,其MLST分型为ST10522型.该株全基因组包括一条完整的基因组(染色体)序列及两条质粒序列,染色体、质粒P1和P2的序列大小分别为5 234 468 bp、117 139 bp和101 356 bp,鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)含量分别为50.48％、49.05％和54.04％.该株染色体、质粒P1和P2分别有4 856、140和116个基因.其耐药基因多位于染色体,主要为耐多药外排泵基因簇,P2仅携带β-内酰胺酶基因blaTEM-1和四环素耐药基因tetG.UPEC132毒力基因也位于染色体,主要为菌毛黏附素9种、铁摄取系统5种和分泌性毒素3种.Afa菌毛和Ⅳ型菌毛基因簇分别位于质粒P1和P2上.系统进化树分析显示UPEC132与23株UPEC均不在同一分支.结论 UPEC132株的ST10522型为国内外首次报道的大肠埃希菌新ST型,其全基因组遗传信息被全面揭示,耐药性和致病性与其携带的多种耐药基因和毒力基因相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苏旭		41	189	9.0	11.0
2	张维		18	94	5.0	9.0
3	杨东靖		22	107	6.0	9.0
4	吕莉琨		16	137	6.0	11.0
5	王源		5	28	3.0	5.0
6	李晓燕		13	40	3.0	6.0
7	于爱萍		1	0	0.0	0.0