大豆花叶病毒沈阳分离物全基因测序及系统进化分析

• 作者: 于曼 单宇航 吴元华 夏子豪 安梦楠 李睿 高维达
• 来源期刊: 中国植保导刊
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆花叶病毒沈阳分离物 RT-PCR 全基因组测序 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 17-21
• 页数: 5页
• 分类号: S435.651
• 字数: 2674字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6820.2020.02.003

摘要

对采自辽宁省沈阳市大豆生产田的大豆花叶病毒沈阳分离物(SMV-SY)进行了基因全序列的克隆及序列分析.经提取叶片总RNA,进行了RT-PCR鉴定.结果 表明,其SMV-SY整条基因组由9 587个碱基组成,编码多聚蛋白的开放阅读框位于第132～9 335 nt,得到全基因序列上传至NCBI数据库,获得登录号为MK350280;BLAST比对结果显示,SMV-SY与其他分离物全基因组核苷酸序列之间的一致性在90.94％～96.86％;与国内外SMV不同分离物构建全基因组核苷酸序列系统进化树.分析表明,其与中国哈尔滨、江苏、以及伊朗和美国的分离物亲缘关系较近,与中国河北、重庆、南昌、广西、以及韩国和加拿大的分离物关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴元华	沈阳农业大学植物保护学院	159	2074	24.0	38.0
2	安梦楠	沈阳农业大学植物保护学院	17	34	3.0	5.0
3	于曼	沈阳农业大学植物保护学院	3	1	1.0	1.0
4	夏子豪	沈阳农业大学植物保护学院	3	2	1.0	1.0
5	李睿	沈阳农业大学植物保护学院	2	1	1.0	1.0
6	单宇航	沈阳农业大学植物保护学院	1	0	0.0	0.0
7	高维达	沈阳农业大学植物保护学院	1	0	0.0	0.0