大豆种子成熟蛋白PM40基因表达方式分析及其启动子预测

• 作者: 刘阔成 孙天国 王珏 赵艳 马晓宇
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 大豆 PM40基因 启动子 生物信息学 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 分类号: Q78|Q565.03
• 字数: 3234字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190591

摘要

研究大豆种子成熟蛋白PM40基因在不同逆境条件下及大豆各组织中的表达情况,并对其上游启动子序列进行生物信息学预测,为揭示PM40基因表达本质及其启动子的功能研究、利用提供理论依据.利用qRT-PCR方法,检测PM40基因在干旱、盐、低温、脱落酸条件下的表达;比较该基因在大豆根、茎、叶、花、30DAF、60DAF和90DAF中的表达;克隆PM40基因5'端上游启动子序列,并预测其含有的顺式作用元件.结果表明,PM40基因在干旱、低温和脱落酸处理不同时间下,与未处理相比,表达量均下降,在盐处理条件下,只有处理2h时表达升高,其余处理时间基因表达下降,说明PM40基因受干旱、低温和脱落酸诱导表达下降,在盐诱导2 h时表达升高;PM40基因在大豆种子中的表达相对较高,尤其是60DAF和90DAF的种子中,相对于根的表达量为35.76,239.75倍;以大豆基因组DNA为模板,克隆PM40基因5'端上游启动子序列1581 bp,生物信息学预测表明,PM40基因启动子序列中包含多种与种子高表达相关的顺式元件.推测大豆PM40基因启动子可能具有种子特异表达特性.