羊草GST基因的克隆及序列分析

• 作者: 汪自庆 邢磊 郭园艺 麻鹏达
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 羊草 GST蛋白 RACE 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 专题:乡土种质资源与草地生态修复
• 页码范围: 48-56
• 页数: 9页
• 分类号: Q943.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13842/j.cnki.issn1671-8151.201910006

摘要

[目的]本研究旨在为盐碱环境下分析羊草耐受性分子机制提供理论基础.[方法]以羊草(Leymus chinensis)的EST(expressed sequence tags,ESTs)序列作为克隆的基础,采用能从低丰度转录本中快速克隆出cDNA的5'及3'末端的RACE技术,获得羊草GST基因(LcGST),并利用生物信息学软件对该基因进行分析.[结果]克隆获得基因全长为833 bp的LcGST基因序列,该基因存在645 bp的开放读码框,编码的蛋白为217个氨基酸构成的稳定弱酸性亲水蛋白,其分子量大小为24.78 kDa.羊草LcGST蛋白预测具有4个磷酸化修饰位点,不具有糖基化修饰位点.也不含有信号肽结构和跨膜结构域,但拥有两个典型的GST保守结构域.其二级结构和三级结构以 α 螺旋为主,伴以少量 β 折叠.进化关系中,羊草与二穗短柄草最近,次之为日本稻和小米,与菠萝和番茄是进化关系最远的.[结论]本研究发现的羊草GST蛋白的理化性质及对其功能结构域的分析有助于为GST基因应用于植物的耐盐碱优良性状的改良奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪自庆	西北农林科技大学理学院	7	12	3.0	3.0
2	麻鹏达	西北农林科技大学生命科学学院	12	33	4.0	4.0
3	邢磊	西北农林科技大学理学院	1	0	0.0	0.0
4	郭园艺	西北农林科技大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0