产絮凝剂菌株Pseudoalteromonas undina JP的表型特征及基因组学分析

• 作者: 王玉霞 崔霞 周海军 穆军
• 来源期刊: 浙江海洋大学学报（自然科学版）
• 关键词: 菲律宾蛤仔黏附污泥 产絮凝剂菌株 Pseudoalteromonas undina 基因组测序 胞外多糖
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 页码范围: 388-393,414
• 页数: 7页
• 分类号: X703.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-830X.2020.05.002

摘要

从菲律宾蛤仔黏附污泥中分离到1株絮凝率高达80.0％的高絮凝活性菌株JP,结合其序列比对和生理生化指标结果,菌株JP被鉴定为Pseudoalteromonas undina.通过Illumina测序平台对菌株JP进行基因组框架序列扫描测序,获得20个总长度为4046116 bp的框架序列,在这些框架序列中共预测到14个rRNA、87个tRNA和3746个基因,注释结果表明其主要参与肽聚糖、脂多糖、氨基糖、核苷酸糖、淀粉、蔗糖、果糖、甘露糖的生物代谢.产胞外多糖类絮凝剂代谢途径中关键前体、重复寡糖单元和调控基因均有发现,虽未找到eps基因簇,推测其可能具有与eps基因簇相似的基因承担对应的功能.