乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因的网络分析

• 作者: 刘儒 徐凤英 曲一帆 王玉珍 肖伟利 谢基明 马丽
• 来源期刊: 吉林大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 乳腺肿瘤 Rab7a 三阴性乳腺癌 MDA-MB-231细胞 一体化通路分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 464-469,后插3
• 页数: 7页
• 分类号: R737.9
• 字数: 3656字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13481/j.1671-587x.20200306

摘要

目的:探讨三阴性乳腺癌(TNBC) MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除后相关基因表达的变化,阐明Rab7a相关基因在TNBC中的作用.方法:选取对数生长期的乳腺癌ZR-75-30、MCF-7、T-47D、MDA-MB-231和HCC-1937细胞,采用Western blotting法检测乳腺癌ZR-75-30、MCF-7、T-47D、MDA-MB-231和HCC-1937细胞中Rab7a蛋白表达水平.慢病毒敲除TNBC MDA-MB-231细胞中Rab7a基因,分为阴性对照组和Rab7a基因敲除组,根据敲除的4种不同Rab7a序列分为KD1组、KD2组、KD3组和KD4组.采用qPCR法检测各组MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除效率,全基因表达谱芯片检测Rab7a基因敲除效率最高组(KD2组)和阴性对照组差异基因,一体化通路分析(IPA)软件分析Rab7a基因与其他基因的相互作用.结果:在TNBC MDA-MB-231细胞中可见Rab7a蛋白表达.与阴性对照组比较,KD2组乳腺癌MDA-MB-231细胞中Rab7a基因敲除效率最高(P＜0.01);与阴性对照组比较,KD2组乳腺癌MDA-MB-231细胞中有634个差异基因,其中上调基因和下调基因数均增多(P＜0.01);差异基因分析,Rab7a基因敲除与癌症、细胞存活、细胞周期和细胞生长及转移等有密切联系;Rab7a的IPA网络图中eIF4F、IRS1和RPS6KB1表达下调,PRKAA1、IKBKE、VEGFA和转录因子ATF2表达上调.结论:Rab7a基因在TNBC MDA-MB-231细胞中以基因网络的形式发挥作用;Rab7a基因与多基因相互作用,参与癌细胞的病理过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢基明	内蒙古自治区人民医院检验科	17	68	5.0	7.0
2	王玉珍	内蒙古农业大学生命科学学院	17	56	4.0	7.0
3	刘儒	内蒙古医科大学研究生学院	5	14	2.0	3.0
4	马丽	内蒙古医科大学研究生学院	10	20	3.0	4.0
5	肖伟利	内蒙古自治区人民医院检验科	14	37	4.0	5.0
6	徐凤英	内蒙古医科大学研究生学院	2	0	0.0	0.0
7	曲一帆	内蒙古医科大学研究生学院	3	1	1.0	1.0