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DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值
DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值
作者:
周钢桥
曹鹏博
骆红波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝癌
转录组
表观基因组
预后模型
摘要:
肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,简称肝癌)是最常见的恶性肿瘤之一.DNA甲基化的异常是恶性肿瘤的特征之一,并被发现在肝癌等肿瘤的发生发展中发挥重要作用.为了能为肝癌患者提供新的临床预后预测标志物,本研究首先采用整合组学分析策略在全基因组范围内鉴定与肝癌患者预后相关的DNA甲基化驱动的差异表达基因;然后,采用LASSO(least absolute shrinkage and selection operator)分析建立了10个最优基因组合的预后预测模型.Cox比例风险回归分析显示,在校正临床特征参数后,此预测模型高风险评分与患者不良预后显著相关,表明该模型具有潜在的独立预后价值.受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析显示该风险评分模型在预测患者短期和长期预后方面优于其他已被报道的肝癌预后预测模型.基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)表明,高风险评分与细胞周期和DNA损伤修复通路相关.以上结果表明,本研究构建了一个基于10个DNA甲基化驱动基因的预后风险评分模型,该模型可作为肝癌患者的潜在预后生物标志物,有助于肝癌患者的生存预后评估和治疗策略的指导.
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篇名
DNA甲基化驱动的转录表达特征作为肝癌预后预测标志物的价值
来源期刊
遗传
学科
关键词
肝癌
转录组
表观基因组
预后模型
年,卷(期)
2020,(8)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
775-787
页数
13页
分类号
字数
8705字
语种
中文
DOI
10.16288/j.yczz.20-139
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
骆红波
贵州大学医学院
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肝癌
转录组
表观基因组
预后模型
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
遗传
主办单位:
中国遗传学会
中国科学院遗传与发育生物学研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9772
CN:
11-1913/R
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号院
邮发代号:
2-810
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
3898
总下载数(次)
19
总被引数(次)
79934
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