转录组-芯片数据联合分析鉴定鼻咽癌发生潜在关键信号通路和调节基因

• 作者: 孙海力 李绍霄 林海亮
• 来源期刊: 中国耳鼻咽喉头颈外科
• 关键词: 鼻咽肿瘤 信号通路 芯片
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 119-122
• 页数: 4页
• 字数: 3407字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16066/j.1672-7002.2020.03.002

摘要

目的 本文主要探究鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)发生的潜在关键基因和信号通路.方法 通过GEO数据库中2个转录组测序数据以及1个芯片数据,总计包括57例鼻咽癌数据和9个正常对照组数据,筛选出差异表达的基因,再进行GO和KEGG等分析.结果 筛选得到580个共有上调表达基因,52个共有下调表达基因.上调基因主要与表皮、腺体和皮肤等与上皮发育相关的信号通路有关.下调基因主要与白细胞凋亡过程的负调控、Notch信号通路等有关.利用蛋白互作网络筛选,结果显示这些关键蛋白主要与G-蛋白耦合受体信号通路,趋化因子传导信号通路等有关.结论 通过联合分析转录组和芯片数据,发现了与鼻咽癌的发生有关的信号通路和关键基因,为鉴定鼻咽癌的发生发展提供了重要依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙海力	温州医科大学附属平阳医院耳鼻喉头颈外科	1	0	0.0	0.0
2	李绍霄	温州医科大学附属平阳医院耳鼻喉头颈外科	1	0	0.0	0.0
3	林海亮	温州医科大学附属平阳医院耳鼻喉头颈外科	1	0	0.0	0.0