西番莲PeERG基因克隆及其表达模式分析

• 作者: 冉娜 张洪亮 李安定 樊航 胥猛
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: ERA蛋白 西番莲 RACE 表达模式 G蛋白 低温胁迫
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 系统与进化
• 页码范围: 509-517
• 页数: 9页
• 分类号: Q943
• 字数: 5158字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201812036

摘要

ERA(Eecherichia coli Ras-like protein)蛋白是与已知异三聚体G蛋白和小分子G蛋白不同的一种新的GTP结合蛋白.为了在木本植物中开展其同源基因ERG(ERA-like GTPase)克隆和功能验证的相关研究,该文首次在西番莲新品种'平塘1号'中采用cDNA末端快速克隆(RACE)技术克隆鉴定1个ERG基因.结果表明:西番莲PeERG基因cDNA全长为1518 bp,包括1260 bp的开放阅读框、38 bp的5′-端非翻译区和220 bp的3′-端非翻译区,该基因编码蛋白由420个氨基酸残基组成,其二级结构含有丰富的α-螺旋和延伸链.PeERG蛋白不含跨膜区域,也不存在信号肽酶切位点,既在其N端有典型的GTPase保守结构域(GTPase domain)又在其C端有独特的RNA结合结构域(KH domain).系统进化树分析表明,西番莲PeERG蛋白和水稻OsERG1、拟南芥AtERG1、大肠杆菌ERA位于同一进化分枝.实时定量PCR检测揭示PeERG基因在西番莲根、茎、叶、花、果中均有表达,叶中表达最高;同时该基因响应低温胁迫信号,其表达呈动态变化模式.该研究首次鉴定和描述了木本植物西番莲的ERG基因,为深入挖掘西番莲特异基因资源提供参考,也有助于进一步探究ERG基因在植物中的生物学功能及其作用机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李安定	贵州科学院贵州省山地资源研究所	45	405	10.0	18.0
5	胥猛	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	16	121	5.0	11.0
9	张洪亮		7	22	3.0	4.0
10	樊航	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	2	0	0.0	0.0
14	冉娜	南京林业大学南方现代林业协同创新中心	1	0	0.0	0.0