木薯种茎劣变的蛋白质组学分析

• 作者: 刘子凡 廖道龙 陈晨 魏云霞 黄洁
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 木薯 种茎 劣变 蛋白质组学
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生物科学与技术
• 页码范围: 402-409
• 页数: 8页
• 分类号: S533.01
• 字数: 4812字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2020.04.004

摘要

以华南8号(SC8)和南植199(NZ199)种茎为试验材料,分析其在老化0、2、4、6 d的蛋白质表达差异.与老化0 d的种茎相比,老化2、4、6 d的种茎,SC8的差异表达蛋白质总数分别为38、64和68个,上调表达的差异蛋白质数分别为11、18和25个,下调表达的差异蛋白质数分别为27、46和43个;NZ199的差异表达蛋白质总数分别为55、63和84个,上调表达的差异蛋白质数分别为17、23和43个,下调表达的差异蛋白质数分别为38、40和41个.与老化0、2、4 d凝胶相比,老化6 d种茎的凝胶中,SC8、NZ199分别检测到19、36个共有差异蛋白质点,且分别有17、30个被成功匹配;2个品种种茎差异蛋白点功能基本相似,主要涉及分子伴侣、碳水化合物和能量代谢、转移、防御、解毒和抗氧化等相关蛋白质.在成功匹配的差异蛋白质中,D-3-磷酸甘油脱氢酶、磷酸甘油酸激酶、类壳三糖苷酶-1蛋白、苹果酸酶、拟定肉桂醇脱氢酸、1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶等差异蛋白质下调表达;拟定谷胱甘肽硫-转移酶parC、类异黄酮还原酶、病程相关蛋白Bet v I家族、热激蛋白、GPN60蛋白、α-淀粉酶、ATP合成酶 β 亚基和烯醇化酶等差异蛋白质上调表达.差异表达蛋白质主要参与对氧化应激反应、毒素分解、谷胱甘肽代谢、蛋白质折叠和糖酵解等生物过程,分布于线粒体、叶绿体、溶质、细胞质、细胞壁等位置,主要发挥结合功能、催化活性和氧化还原功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘子凡	海南大学热带作物学院	50	267	8.0	14.0
2	黄洁	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	87	1117	16.0	29.0
4	廖道龙	海南省农业科学院蔬菜研究所	24	74	5.0	7.0
5	陈晨	海南大学热带作物学院	5	2	1.0	1.0
6	魏云霞	中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所	13	66	5.0	8.0