福建省新型冠状病毒的分离和全基因组特征分析

• 作者: 何文祥 俞婷婷 修文琼 吴冰珊 吴晶晶 张小鸿 张炎华 朱颖 游丽斌 王金章 翁育伟 袁平 郑奎城 鄢育青 陈宏彬 陈炜 骆婧 黄枝妙
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 新型冠状病毒 病毒分离 全基因组
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 349-353
• 页数: 5页
• 分类号: R373.1|R563.1
• 字数: 3566字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2020.00.059

摘要

目的 从福建省早期新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例中分离新型冠状病毒(2019-nCoV)并了解病毒基因组特征.方法 将福建省早期COVID-19患者的咽拭子样本接种至Vero-E6细胞,培养上清提取核酸,经real-time RT-PCR法验证后,利用Ion Torrent S5深度测序仪做全基因组测序,分析病毒株全基因组序列与参考序列的一致性和进化情况.结果 12份咽拭子样本经培养后有2份样本病毒滴度明显上升,表明分离到2株2019-nCoV,其全基因组结构蛋白与Wuhan-Hu-1株的一致性超过99.9％.结论 成功自福建省早期COVID-19病例中分离到2019-nCoV,病毒分离株的基因序列与湖北武汉流行的2019-nCoV高度同源,提示病毒尚未发生明显变异.