基于GTEx数据库对COVID-19结合基因ACE2的分析

• 作者: 余克富 徐蓓 梅升辉 赵志刚 雷莉
• 来源期刊: 中南药学
• 学科: 医学
• 关键词: GTEx数据集 血管紧张素转化酶2 新型冠状病毒肺炎 富集分析
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 新型冠状病毒肺炎防治专题
• 页码范围: 1460-1463
• 页数: 4页
• 分类号: R743
• 语种: 中文
• DOI: 10.7539/j.issn.1672-2981.2020.09.003

摘要

目的 探讨血管紧张素转化酶2受体基因(ACE2)在正常人组织器官中的表达,结合新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者临床症状分析两者间的关系,利用生物信息学方法揭示ACE2可能的效应通路.方法 从基因型-组织表达(GTEx)数据库下载ACE2在人体各组织的表达数据,并用R软件对数据进行处理.通过GO富集分析其相关机制,并探讨长链非编码RNA和ACE2的相关性.结果 ACE2在正常人体不同器官均有一定程度的表达,表达量从高到低依次为:心、肾、肺、肝、胃、脑、脾,差异有统计学意义(F=820.03,P<0.001).ACE2在不同组织中也有一定程度的表达,表达量从高到低依次为:睾丸、脂肪、神经、肌肉、血,差异有统计学意义(F=3592.75,P<0.001).GO富集结果提示,基因ACE2主要参与调节肽和激素的分泌、调节蛋白质异二聚活性;同时长链非编码LINCO2082与ACE2成显著正相关性.结论 ACE2在人体各组织器官均有一定程度的表达,可能与COVID-19患者器官损害存在一定的相关性,临床应密切观察.