马铃薯StUBC12基因的生物信息学及表达特性分析

• 作者: 付学 刘维刚 司怀军 唐勋 张宁 李世贵 祁学红
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯 StUBC12 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 784-793
• 页数: 10页
• 分类号: S532
• 字数: 7430字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.05.003

摘要

泛素蛋白酶体途径广泛参与植物生长发育的各个阶段,其中泛素结合酶E2是该途径中酶联催化的关键酶,在底物泛素化的过程中发挥着重要的作用.本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种'大西洋'叶片cDNA为模板,克隆得到马铃薯泛素结合酶E2(ubiquitin-conjugating enzyme,UBC)基因StUBC12(GenBank No.XM_006343293.2),该基因全长2112 bp,包含3个内含子和4个外显子,编码序列(coding sequence,CDS)区长444 bp.生物信息学分析表明,StUBC12为包含148个氨基酸编码的非跨膜蛋白,具有典型的UQ_con保守结构域.用qRT-PCR技术对马铃薯栽培品种'大西洋'和'青薯9号'的根、茎、叶和花进行基因表达量分析,结果表明该基因在叶和花中的表达量最高,且在'大西洋'中的表达量显著高于'青薯9号';在干旱和盐胁迫条件下,马铃薯StUBC12基因通过上调表达提高植株的抗逆性.研究结果可为进一步研究马铃薯StUBC12基因的功能提供理论依据.