基于多平台数据胆管癌关键差异基因筛选研究

• 作者: 刘洪涛 李医明 王福荣
• 来源期刊: 临床军医杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 胆管癌 差异表达基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 257-259,263
• 页数: 4页
• 分类号: R735.8|R318.04
• 字数: 2313字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16680/j.1671-3826.2020.03.05

摘要

目的 识别胆管癌致病的关键基因及信号通路,为寻找治疗靶点提供数据支持.方法 利用GEO数据库的两个基因芯片数据集GSE26566和GSE76297进行差异基因的筛选,并通过DAVID数据库对其进行功能富集分析.采用STRING数据库构建了基因编码蛋白之间蛋白质-蛋白质相互作用网络,随后导入Cytoscape软件进行可视化分析.通过TCGA和The Human Protein Atlas数据库验证所筛选出的基因在转录组和蛋白表达水平上的差异.结果 共筛选出5个关键差异表达基因,分别是AHSG、SERPINC1、CYP2E1、FGG及TTR,其主要的生物学过程富集在氧化还原反应、药物反应和跨膜转运等方面;信号通路富集在代谢途径、抗生素生物合成、补体途径和细胞色素P450系统等方面.结论 利用生物信息学方法,通过不同数据平台的比较和验证,筛选出胆管癌差异表达的5个核心基因,并在转录和蛋白表达水平进行了验证,为胆管癌临床治疗提供了新的候选分子靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李医明	北部战区总医院和平院区普外科	4	2	1.0	1.0
2	刘洪涛	北部战区总医院和平院区普外科	6	2	1.0	1.0
3	王福荣	北部战区总医院和平院区普外科	4	2	1.0	1.0