伞裙追寄蝇滞育关联基因的转录组学分析

• 作者: 刘爱萍 岳方正 张博 徐林波 甘霖 韩海斌 高书晶
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 伞裙追寄蝇 转录纽测序 滞育 滞育关联基因 KEGG分析
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 932-940
• 页数: 9页
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2020.08.003

摘要

[目的]本研究旨在探讨调控伞裙追寄蝇Exorista civilis滞育的重要关联基因以及代谢途径,为明确该虫在转录组水平下的滞育分子机制提供理论基础.[方法]采用新一代高通量测序平台Illumina HiSeqTM2000对伞裙追寄蝇非滞育以及滞育的蛹进行转录组测序分析以及生物信息学分析;应用KAAS在线pathway比对分析工具对筛选出的满足padj＜0.05且fold change ≥32或padj＜0.05且fold change≤1/32条件的差异表达基因进行KEGG通路富集分析.[结果]根据测序结果,共获取58 050个基因.差异倍数在32倍以上的滞育关联基因(diapause-associated genes,DAGs)有454个,其中406个表达上调,共涉及134条通路,包括氧化磷酸化、柠檬酸循环及其他重要通路;48个表达下调,涉及32条通路.KEGG通路富集分析结果表明,滞育关联基因主要集中在信号转导、内分泌系统、碳水化合物代谢等途径中.[结论]本研究获得的伞裙追寄蝇转录组数据揭示了其滞育调控的重要代谢途径与关联基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘爱萍	中国农业科学院草原研究所	85	543	12.0	15.0
2	徐林波	中国农业科学院草原研究所	64	381	11.0	14.0
3	高书晶	中国农业科学院草原研究所	54	290	10.0	12.0
4	张博	中国农业科学院草原研究所	54	250	10.0	15.0
5	韩海斌	中国农业科学院草原研究所	21	34	3.0	5.0
6	岳方正	中国农业科学院草原研究所	3	8	2.0	2.0
7	甘霖	中国农业科学院草原研究所	2	15	1.0	2.0