雌、雄弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏转录组比较分析

• 作者: 廖健 张宁 王中铎 董忠典 郭昱嵩 黎学友
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 农学
• 关键词: 弓背青鳉 肝脏 转录组测序 差异基因 生物标志物
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1203-1213
• 页数: 11页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11693/hyhz20191200274

摘要

为发掘弓背青鳉(Oryzias curvinotus)肝脏功能基因、开发环境检测标记基因,本研究采用RNA-Seq技术分别测定了性成熟雌、雄弓背青鳉肝脏转录组,并获得80095044和87043984条clean reads,合并拼接出49912个unigenes (N50=2394bp).基因表达差异分析显示在雌、雄弓背青鳉肝脏组织中存在571个差异基因(DEGs),其中364个在雄鱼中高表达,207个在雌鱼中高表达.GO和KEGG分析表明差异基因主要参与激素合成、免疫反应、氧化还原反应及卵黄发生等生物学过程.进一步,在转录组中筛选到了多个环境雌激素相关标记基因(vtgs,chgs,er,cyp450等),且这些基因在雌鱼肝脏中的表达水平显著高于雄鱼.研究结果丰富了弓背青鳉的基因资源,为研究基因功能提供了数据,也有助于进一步研究鱼类肝脏在不同性别之间的功能.