鸡内源性白血病毒ev21与其侧翼区SNP位点的连锁关系

• 作者: 乔宁 李兰会 李雪梅 白少川 葛琳涵 赵丽杰
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 鸡 内源性白血病病毒ev21 SNP 连锁 转录因子
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 页码范围: 101-107
• 页数: 7页
• 分类号: S831.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2020.0119

摘要

鸡内源逆转录病毒ev21的转录表达影响宿主机体健康.本试验通过PCR检测海兰褐、太行鸡、海兰灰和SPF鸡292份DNA样品的ev21阴阳性、羽型和性别,测序筛选ev21插入位点OS和US区的SNP位点,Mbo Ⅱ酶切检测C>T突变的群体多样性,分析C>T突变与ev21整合的连锁关系;最后利用TRANSFAC?Professional预测C>T突变引起的转录因子变化.测序峰图发现,ev21插入位点上游278 bp处的C>T突变.OS和US共有610 bp酶切结果发现,快羽ev21阴性鸡为CC基因型,快羽ev21阳性鸡为CT基因型;慢羽除海兰灰和海兰褐祖代ev21阳性鸡为TT基因型外,其他均为CT基因型.OS特异1036 bp酶切显示ev21整合的OS区全部为T单倍型,C>T突变造成转录因子结合变化.研究表明ev21整合的OS区和未整合的US区的C>T突变有5种单倍型,ev21整合与T等位基因连锁.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李雪梅		69	532	12.0	20.0
2	李兰会		120	583	13.0	17.0
3	葛琳涵		4	5	2.0	2.0
4	白少川		1	0	0.0	0.0
5	赵丽杰		4	11	2.0	3.0
6	乔宁		2	0	0.0	0.0