羊口疮病毒强弱毒株免疫相关基因的比较分析

• 作者: 丁学东 刘冬冬 吉鹏华 张七斤 张艳敏 张静 潘相臣 王国华 田普厚 石顺利 马园
• 来源期刊: 畜牧与饲料科学
• 学科: 农学
• 关键词: ORFV 免疫相关基因 系统进化树 同源性分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 动物疾病防控
• 页码范围: 96-106
• 页数: 11页
• 分类号: S852.659.1|S858.265
• 语种: 中文
• DOI: 10.12160/j.issn.1672-5190.2020.05.018

摘要

通过对采集到的青岛市某发病羊场羊口疮病料(强毒)在山羊成纤维细胞上连续传90代(弱毒)后,分别进行病毒基因组提取,并对提取到的基因组分别命名为ORFV-QD和ORFV-RD.根据GenBank上发表的ORFV全基因组序列设计并合成3对特异性引物,分别扩增ORFV-QD和ORFV-RD的B2L基因、F1L基因和VIR基因片段,并将扩增得到的基因组片段分别克隆到pMD-19T载体上,转化到DH5α感受态细胞中,对重组质粒进行鉴定后送至测序公司进行测序,用DNASTAR软件对测序结果进行拼接及3组基因之间核苷酸同源性比较分析,将测序结果与NCBI上已公布的13组ORFV全基因组相应基因核苷酸序列进行同源性比对分析、构建系统进化树及氨基酸序列比对分析.结果 表明,3组基因与参考序列的B2L基因、F1L基因和VIR基因核苷酸同源性分别为92.1％～98.4％、96.1％～99.1％和94.6％～100％.将2株病毒基因组与参考序列进行氨基酸序列比较分析,结果显示2株病毒基因组之间并没有较为明显的差异.