羊口疮病毒疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因的比较分析

• 作者: 张靖鹏 林裕胜 江锦秀 游伟 胡奇林
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 羊口疮病毒 疫苗株 ORFV-PN ORFV011基因
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 124-129
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.1
• 字数: 4376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.02.002

摘要

[目的]比较分析羊口疮病毒疫苗株与ORFV-PN株ORFV011基因的分子特点、编码蛋白的生物学功能差异,为福建省羊口疮的科学防控提供理论指导.[方法]对羊口疮疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因进行克隆和测序,运用生物信息学相关软件比较分析两者测序结果的差异.[结果]测序结果显示,疫苗株和ORFV-PN株ORFV011基因均由1137个核苷酸组成,编码378个氨基酸.核苷酸序列和氨基酸序列相似性比较显示,ORFV-PN与疫苗株和弱毒株D1701株ORFV011基因核苷酸序列相似性分别为98.6％和98.4％,氨基酸序列相似性均为98.7％.与疫苗株相比,ORFV-PN株共有16处核苷酸变异和5处氨基酸变异.在蛋白二级结构上,ORFV-PN株和疫苗株 α-螺旋占比分别为34.13％(129/378)和30.42％(115/378),β-转角占比分别为6.08％(23/378)和6.88％(26/378),无规则卷曲占比分别为37.30％(141/378)和39.15％(148/378),β-折叠占比分别为22.49％(85/378)和23.54％(89/378).蛋白三级结构上,ORFV-PN株预测的三维结构与疫苗株的三维结构在α-螺旋和无规则卷曲上有一定的差异.[结论]福建省羊口疮病毒ORFV011基因出现变异,应当引起广大兽医工作者的重视,有关部门应当加强对羊口疮的监测.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡奇林	福建省农业科学院畜牧兽医研究所	57	410	11.0	17.0
2	林裕胜	福建省农业科学院畜牧兽医研究所	40	164	8.0	11.0
3	江锦秀	福建省农业科学院畜牧兽医研究所	30	100	5.0	8.0
4	张靖鹏	福建省农业科学院畜牧兽医研究所	18	29	3.0	4.0
5	游伟	福建省农业科学院畜牧兽医研究所	27	76	5.0	7.0