羊口疮病毒QD/2015株B2L基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 仲亮 刘春羽 张七斤 张静 李智 牛云雷 王海峰 范俊豪
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 羊口疮病毒 B2L基因 生物信息学分析 蛋白结构预测
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 技术支撑
• 页码范围: 91-96
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 4122字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2017.03.024

摘要

为分析羊口疮病毒(ORFV/QD/2015株)B2L基因的分子特征,预测其编码蛋白的生物学功能,对其B2L基因进行PCR扩增、克隆及序列测定,应用生物信息学相关软件及方法,对扩增所得的基因进行序列分析,并对其编码蛋白的二级结构、细胞抗原表位、三级结构、跨膜结构域和信号肽等进行预测和分析.结果显示:ORFV/QD/2015株B2L基因序列长1137 bp,编码379个氨基酸;该毒株与其他12株羊口疮病毒参考株的B2L基因核苷酸序列同源性为96.8%~99.7%,氨基酸序列同源性为96.8%~99.2%.系统进化分析显示,ORFV/QD/2015株与2015年分离到的ORFV/ShaanXi/2015/China株亲缘关系最近;B2L基因编码蛋白二级结构以 α-螺旋区域和 β-折叠区域所占比例较大,预测此蛋白可能存在7个细胞优势抗原表位,无跨膜区域,无信号肽区域;三级结构呈弯曲状螺旋结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王海峰	内蒙古农业大学兽医学院	3	13	2.0	3.0
2	李智	内蒙古农业大学兽医学院	14	52	5.0	6.0
3	仲亮	内蒙古农业大学兽医学院	4	17	3.0	4.0
4	张静	内蒙古农业大学兽医学院	36	279	8.0	16.0
5	刘春羽	内蒙古农业大学兽医学院	3	14	3.0	3.0
6	范俊豪	内蒙古农业大学兽医学院	1	7	1.0	1.0
7	牛云雷		1	7	1.0	1.0