羊口疮病毒凤翔株ORFV121和vIL-10基因的生物信息学分析

• 作者: 刘慧 刘方 安贝 张立强 贾芸晓 赵玄多 陈德坤 高洋
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 羊口疮病毒凤翔株 ORFV121 vIL-10 基因差异
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 52-58
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.1
• 字数: 3353字
• 语种: 中文

摘要

为分析羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因在凤翔(FX0910)强毒株(vORFV)和弱毒株(lvORFV)之间的差异,应用PCR方法扩增羊口疮病毒ORFV121和vIL-10基因的全长序列并测序,应用生物信息学软件分析基因的核酸、氨基酸相似性,蛋白的亲水性、二级结构以及抗原性.结果显示,lvORFV的ORFV121基因118位的谷氨酸缺失,说明该处发生的碱基突变为有意突变,该突变导致弱毒株相应蛋白的亲水性、二级结构发生变化,蛋白的抗原性在很多区域发生本质改变;vIL-10在蛋白质水平出现了5个氨基酸位点突变(14:V→W,49:A→P,57:T→M,72:R→C,102:I→V)和79位插入1个色氨酸.这些位点差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生了变化.ORFV121基因和vIL-10基因在vORFV和lvORFV之间存在差异,这些基因差异导致蛋白的亲水性、二级结构和抗原性发生改变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈德坤	西北农林科技大学动物医学院	100	613	13.0	20.0
2	刘慧	西北农林科技大学动物医学院	8	48	4.0	6.0
3	赵玄多	西北农林科技大学动物医学院	5	10	2.0	2.0
4	张立强	西北农林科技大学动物医学院	3	12	2.0	3.0
5	高洋	西北农林科技大学动物医学院	15	34	4.0	5.0
6	安贝	西北农林科技大学动物医学院	3	10	2.0	3.0
7	刘方	西北农林科技大学动物医学院	2	4	1.0	2.0
8	贾芸晓	西北农林科技大学动物医学院	1	4	1.0	1.0