基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘双酚A代替物的分子作用机制

• 作者: 吕钧慧 周蕾 李培锋 王悦
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: BPA代替物 分子对接 权重基因共表达网络分析 蛋白互作网络 基因-疾病关联分析
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 基础兽医学
• 页码范围: 785-790
• 页数: 6页
• 分类号: S852.21
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.04.21

摘要

评估双酚A(bisphenol A,BPA)代替物的内分泌干扰活性并挖掘其分子作用机理.采用分子对接技术模拟预测BPA代替物对人雌激素受体α(estrogen receptor,ERα)的结合活性;构建权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)找到BPA代替物和细胞增殖之间强相关的模块和基因;构建蛋白互作网络(protein protein interaction network,PPI),找到BPA代替物发挥雌激素活性的枢纽基因(Hub gene);基因-疾病关联(gene-disease associations)分析找到与BPA代替物高度相关的人类疾病.结果 表明,6种BPA均具有雌激素活性;WGCNA分析找到2个模块共1 090个基因与细胞增殖强相关的基因;PPI挖掘到BPA代替物发挥雌激素作用的Hub gene是孕酮受体(rrogesterone receptor,PGR)、Myb相关蛋白(Myb-related protein like 1,MYBL1)、过氧化物酶体增殖剂激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)和MYB原癌基因转录因子(MYB);基因-疾病关联分析表明BPA代替物可能对机体的乳腺肿瘤、子宫内膜癌和糖尿病等疾病的发生发展过程产生不良影响.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李培锋	内蒙古农业大学兽医学院	124	808	15.0	21.0
2	王悦	北京大学城市与环境学院	137	1154	17.0	30.0
3	周蕾	内蒙古农业大学兽医学院	7	15	2.0	3.0
7	吕钧慧	北京大学城市与环境学院	2	0	0.0	0.0