基于KEGG通路和蛋白互作对慢性心力衰竭靶点基因的筛选

• 作者: 周国锋 张永健 李晓 杨金龙 王永成 迟辰昱 陈纪烨 韩晓伟
• 来源期刊: 临床心血管病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 信号通路 蛋白互作 慢性心力衰竭 靶点蛋白
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 心力衰竭
• 页码范围: 355-362
• 页数: 8页
• 分类号: R541.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.13201/j.issn.1001-1439.2020.04.012

摘要

目的:运用KEGG通路和蛋白互作筛选出慢性心力衰竭(CHF)靶点基因.方法:以“chronic heart failure”为关键词在NCBI数据库中检索CHF相关靶点基因,并运用R语言相关数据包进行KEGG通路分析,获得CHF的关键通路.对关键通路分析,筛选出CHF相关靶点基因和关键靶点基因.结果:在NCBI数据库检索到CHF相关靶点基因119个,获得关键通路后分析获得9个CHF靶点基因,为IL10,IL6,NOS3,TNF,VCAM1,AGT,EDN1,IFNG,IL17A,5个CHF关键靶点基因,分别为IL6,NOS3,TNF,VCAM1,IL10.结论:运用KEGG通路和蛋白互作筛选出CHF关键靶点基因,为进一步研究CHF的分子机制以及新药的开发奠定了基础.