美国红枫叶片转录组分析

• 作者: 李玉娟 王莹 谈峰 郭聪 陈燕
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 美国红枫 转录组 叶色变化 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 441-454
• 页数: 14页
• 分类号: S792
• 字数: 8651字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.03.007

摘要

美国红枫(Acer rubrum)叶色鲜红美丽,在园林植物中被广泛的应用,同时也常用作防护林树种和风景林树种.为了了解美国红枫转色期叶片中差异表达基因及分子调控途径,本研究对美国红枫转色期叶片进行RNA-Seq测序和分析,共获得unigenes 78571条,总长度为71788869 bp,平均长度913.68 bp.通过与蛋白数据库的比对,48387条unigenes可获得注释信息.基因本体(Gene Ontology,GO)分析发现注释到的基因涉及53个功能组,其中代谢过程(生物学过程)、细胞(细胞组分)以及催化活性(分子功能)的富集程度较高.KEGG分析发现差异表达基因主要对核糖体代谢等生物学过程进行调节.在叶片转色期间,共筛选出7个与花青素相关的转录因子,主要经丙烷类生物合成、花青素生物合成、类黄酮生物合成等机制介导美国红枫叶色调控.同时发现这7个转录因子在红叶或者花叶中表达量较高,进一步提示其在美国红枫叶片转色期可能发挥重要的作用.本研究结果为探究美国红枫叶色变化的分子机制研究提供了参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李玉娟		27	118	5.0	10.0
2	王莹		21	38	3.0	4.0
3	谈峰		21	48	4.0	6.0
4	郭聪		12	6	2.0	2.0
5	陈燕		1	0	0.0	0.0