基于SSR标记的朝天椒种质遗传多样性分析

• 作者: 任佳佳 吴培云 安朝龙 张曼 李伟 王钦 谢龙安
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 朝天椒 种质资源 SSR标记 遗传多样性 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 101-109
• 页数: 9页
• 分类号: S641.3
• 字数: 4218字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.07.014

摘要

探究以贵州为主的西南地区朝天椒种质遗传多样性,为朝天椒种质的保续、利用与分子标记辅助选择提供准确参考依据.利用20个SSR(简单串联重复序列)分子标记,对112份西南地区朝天椒种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,20对SSR引物共检测出65个等位变异,每对引物的等位变异为2～4个,平均每对引物3.25个等位变异,平均有效等位基因数为1.8294,平均多态性信息量(PIC)为0.5440,平均Shannon's信息指数(I)为0.7234,观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、Nei's期望杂合度的平均值分别为0.4920、0.4337、0.4318,所筛选出的20对SSR引物多态性较高,能较好地反映朝天椒不同地方种间的遗传多样性信息.聚类结果表明,供试材料居群间遗传相似系数(GS)值为0.5692～0.9538,平均值为0.7733,朝天椒种质间的遗传相似性相对较高,材料间的亲缘关系比较接近.在GS值0.7670处将供试材料分为4类,显示出112份朝天椒材料总体情况与地理分布有一定关联,但也存在区域间和省内外间的互相渗透,每个类别均聚集了不同地理来源的种质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伟	贵州大学农学院	64	168	7.0	10.0
2	张曼	贵州大学农学院	12	26	3.0	4.0
3	谢龙安		7	16	3.0	3.0
4	王钦	贵州大学农学院	2	0	0.0	0.0
5	任佳佳	贵州大学农学院	1	0	0.0	0.0
6	安朝龙	贵州大学农学院	1	0	0.0	0.0
7	吴培云	贵州大学农学院	1	0	0.0	0.0