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摘要:
卵巢癌是一种早期诊断率低而致死率较高的恶性肿瘤,对其预后标志物的鉴定和生存率的预测仍是生存分析的重要任务.利用卵巢癌预后相关基因构建基因共表达网络,鉴定预后生物标志物并进行生存率的预测.首先,对TCGA(The cancer genome atlas)数据库下载的卵巢癌基因表达数据实施单因素回归分析,利用得到的747个预后相关基因构建卵巢癌预后加权基因共表达网络.其次,考虑网络的生物学意义,利用蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)数据对共表达网络中的模块重新加权,并根据网络中基因的拓扑重要性对基因进行排序.最后,运用Cox比例风险回归对网络中的重要基因构建卵巢癌预后模型,鉴定了3个预后生物标志物.生存分析结果显示,这3个标志物能够显著区分不同预后的患者,较好地预测卵巢癌患者的预后情况.
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篇名 卵巢癌基因共表达网络及预后标志物的研究
来源期刊 生物学杂志 学科 生物学
关键词 卵巢癌 生物标志物 预后模型 加权基因共表达网络分析( WGCNA)
年,卷(期) 2020,(5) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 10-14,23
页数 6页 分类号 Q737.31|Q78
字数 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.2095-1736.2020.05.010
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作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 朱平 60 186 7.0 12.0
2 顾云婧 2 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
卵巢癌
生物标志物
预后模型
加权基因共表达网络分析( WGCNA)
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物学杂志
双月刊
2095-1736
34-1081/Q
大16开
安徽省合肥市花园街83号合肥大厦9楼
26-50
1983
chi
出版文献量(篇)
3549
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14
总被引数(次)
25351
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