利用Pdl1敲除的巨噬细胞转录谱分析结核感染中PD-L1作用相关的候选基因

• 作者: 占玲俊 唐军 李军丽 王杰 石亚男
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 巨噬细胞 Pdl1基因敲除 Cre/loxp重组酶系统 转录组测序
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 31-39
• 页数: 9页
• 分类号: R-33
• 字数: 6595字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-7856.2020.05.006

摘要

目的 分析结核菌(Mtb)感染的程序性死亡配体1(Pdl1)特异性敲除的巨噬细胞(MΦ)转录谱变化,筛选MΦ内PD-L1作用相关的候选基因.方法 构建敲除小鼠(Pdl1Flox-),通过Cre-loxp技术培育出MΦ上Pdl1特异性敲除的纯合和杂合小鼠(Pdl1Flox/Flox-Cre,Pdl1Flox/--Cre),用PCR和流式细胞术验证.分离上述小鼠腹腔MΦ,利用转录组测序技术检测Mtb感染MΦ 24 h的表达谱,以同窝阴性小鼠(Pdl1Flox/Flox)为对照,进行生物信息学分析.结果 PCR和流式细胞术证实小鼠敲除成功.纯合、杂合及同窝阴性小鼠感染前后相比,差异表达基因最显著富集项为参与免疫反应和免疫过程的GO(P< 0.01;P< 0.01),筛出17个PD-L1相关的候选基因.通过KEGG富集分析,最显著富集的通路有Toll样受体、NF-κB信号通路等(P < 0.01;P < 0.01),筛出6个候选基因.结论 通过转录谱分析,确定与免疫反应及免疫过程有关的Ccl2、Qa5、Il12a等17个基因,免疫及炎症相关代谢通路的Ptgs2、Cd40、Card11等6个基因为Mtb感染的MΦ内PD-L1相关的候选基因,除Il6外均为本研究新筛选的候选基因.