新型冠状病毒棘突蛋白免疫原性分析及其多肽疫苗设计研究

• 作者: 朱颖 胡巧丽 胡晓军 许志强 郭有 鲁陈
• 来源期刊: 赣南医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 三维结构模拟 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 新型冠状病毒专题
• 页码范围: 217-224
• 页数: 8页
• 分类号: R392.11
• 字数: 5815字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5779.2020.03.001

摘要

目的:分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)表面棘突蛋白的结构和B细胞表位.方法:首先利用Protparam 对SARS-CoV-2棘突蛋白的物理化学性质特征进行分析.随后通过Clustal软件,对SARS-CoV-2和SARS-CoV棘突蛋白中的功能区域进行分析,并结合同源模拟,明确棘突蛋白的空间结构和折叠特征.综合DNAStar、ABCpred和BepiPred结果,筛选SARS-CoV-2棘突蛋白的线性B细胞表位,同时利用ElliPro、DiscoTope、SEPPA对棘突蛋白的构象B细胞表位进行综合预测.结果:通过同源模拟,SARS-CoV-2的棘突蛋白是同源三聚体结构,并且与SARS-CoV的棘突蛋白相似,也具有两种受体结合区域构象.通过综合多种免疫信息学工具及进一步筛选,11条线性表位(B9-B14和B27-B31)及5条构象表位(CB4-CB8)被筛出.结论:本研究筛选出的SARS-CoV-2棘突蛋白的16条B细胞表位,包括11条线性表位(B9-B14和B27-B31)及5条构象表位(CB4-CB8),可作为潜在的新型冠状病毒肺炎免疫原疫苗研发的候选表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱颖	赣南医学院第一附属医院	25	53	4.0	6.0
3	郭有	赣南医学院第一附属医院	13	21	3.0	4.0
4	鲁陈	赣南医学院第一附属医院	24	36	3.0	5.0
7	许志强		2	2	1.0	1.0
8	胡晓军		12	22	3.0	4.0
9	胡巧丽		1	0	0.0	0.0