金黄色葡萄球菌的药靶基因预测

• 作者: 向小兵 廖毅 曾凡才 顾洪
• 来源期刊: 青岛大学学报（医学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 金黄色葡萄球菌 抗药性,细菌 基因组岛
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 437-443
• 页数: 7页
• 分类号: Q93-33
• 语种: 中文
• DOI: 10.11712/jms.2096-5532.2020.56.126

摘要

目的 利用生物信息学方法 从基因层面筛选金黄色葡萄球菌(金葡菌)药靶基因.方法 应用Zcurve、Prodigal等软件重新注释金葡菌基因组并预测到61个漏注释基因,其次列出金葡菌的必需基因170个、高表达基因185个(20～205个)及基因组岛基因32个,通过同源比对排除人类及有益肠道菌群基因,最后在Drug-Bank上检索核查目标药靶.结果 通过反复筛选并排除肠道有益菌群后最终得到SAZ172_0418、SAZ172_0420、SAZ172_1976、SAZ172_1978、SAZ172_1980、SACOL1524、SA2981_1507、SA2981_2326、SA2981_2521、SA2981_1955共10个可作为药靶的基因.结论 筛选出的10个基因可对金葡菌耐药菌株的广谱抗菌药物研制提供理论帮助.