2000——2019年广西狂犬病病毒流行株的基因组遗传稳定性分析

• 作者: 曹晗 李晓宁 梁星雪 梁晶晶 罗廷荣 覃晴 韦显凯
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 狂犬病病毒(RABV) 基因组 遗传稳定性 GroupII型毒株
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 645-651
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.03.022

摘要

[目的]揭示广西狂犬病病毒(RABV)的流行变异规律及进化特征,为广西狂犬病防控提供科学依据.[方法]对2018年从患狂犬病家犬脑组织分离获得的2株RABV野毒株(GXYZ2018和GXSL2018)进行全基因组扩增与测序,测序结果采用SeqMan进行拼接以获得全基因组序列,并与近20年来的RABV广西流行株进行系统地遗传变异分析.[结果]GXSL2018株和GXYZ2018株的全基因组序列长度均为11923 bp,不同RABV广西流行株间的核苷酸序列同源性在87.1％～99.4％,而2株毒株间的同源性为99.1％;与其他RABV广西流行株相比,GXSL2018株和GXYZ2018株的3'-UTR为69 bp,且在第20位缺失一个核苷酸.基于N基因和G基因核苷酸序列同源性构建的遗传进化树均显示GXSL2018株和GXYZ2018株同属于Group II型毒株,且2株毒株N蛋白上的B细胞表面抗原表位(第358～367位氨基酸残基)、Th细胞表位(第404～418位氨基酸残基)和RNA结合域(第298～352位氨基酸残基),以及G蛋白上与病毒毒力密切关联的第333、336、339和357位氨基酸残基及中和抗体相关表位和受体结合位点均高度保守.[结论]GXYZ2018株和GXSL2018株同属于Group II型毒株,与近20年来的RABV广西流行株高度相似,病毒蛋白主要功能区的氨基酸序列高度保守,尚未发生变异,全基因组遗传特性稳定.