采用SLAF-BSA技术分析玉米尾孢菌灰斑病抗性位点

• 作者: 李菁 张小飞
• 来源期刊: 华北农学报
• 关键词: 玉米灰斑病 玉米尾孢菌 集群分离分析 SLAF 功能注释
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 资源环境·植物保护|Resource and Environment·Plant Protection
• 页码范围: 180-186
• 页数: 7页
• 分类号: S435.13
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20191217

摘要

为研究玉米灰斑病的抗病机理,发掘玉米尾孢菌灰斑病抗病基因位点连锁分子标记,以期为分子标记辅助抗性育种提供理论依据.选用玉米尾孢菌灰斑病抗病自交系R225与感病自交系掖478组配F2群体共345个单株,构建抗、感病混池,采用BSA(混合样本分组分析法)和SLAF-seq(特异位点扩增片段测序)技术开发玉米灰斑病抗性相关分子标记,并将关联区域内的基因在数据库中进行比对,对基因信息进行注释.结果 共获得696 139个SLAF标签及559 927个单核苷酸多态性位点(SNP),随后筛选得到49 488个标记进行后续关联分析,最终获得6个抗病相关的候选基因,候选基因功能与丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性、ATP及GTP结合、细胞信号转导及作为一些重要蛋白质的前体或结构域组成等方面相关.结果 表明,利用混合样本分析和简化基因组测序技术能高效、低成本地开发出大量可用于玉米群体遗传分析的SNP标记,获得与性状紧密关联的分子标记和抗病相关的候选基因.