鸭肠炎病毒感染对鸭肠道菌群多样性的影响

• 作者: 张飘 文明 杨霞 杨颖 程振涛 胡安东 蒲翠敏
• 来源期刊: 中国预防兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭肠炎病毒 肠道菌群 高通量测序 鸭
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 病原生物学
• 页码范围: 772-778
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0589.201908012

摘要

为揭示鸭肠炎病毒(DEV)感染对鸭肠道菌群多样性的影响,本研究采用16S rRNA基因高通量测序和Illumina Hiseq 2500高通量测序技术对DEV感染后鸭肠道菌群多样性和丰度进行分析.结果 显示:与对照组比较,感染组鸭肠道菌群Alpha多样性指数均呈先升高后降低趋势,尤其是在DEV感染96h和120 h后,鸭肠道菌群Beta多样性(Weighted Unifrac指数)距离越远,相似度越低;DEV感染后鸭肠道优势菌群主要分布于厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门和梭杆菌门,梭菌纲、丙型变形菌纲、拟杆菌纲和梭杆菌纲,梭菌目、肠杆菌目、拟杆菌目和梭杆菌目,肠杆菌科、消化链球菌科、拟杆菌科和梭杆菌科,大肠杆菌志贺菌亚属、拟杆菌属、梭菌属和Turicibacter属,尤其是产气荚膜梭菌和坏死梭杆菌呈先下降后升高趋势,这可能与DEV感染所导致的肠道病变存在一定的关联性.本研究结果为DEV致病机理及其所致疾病的防控研究奠定了基础.