广东省大豆种质资源遗传多样性分析及DNA分子身份证构建

• 作者: 刘军 吴柔贤 宋松泉 张文虎 李清 罗永坚 贾俊婷
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 SSR 遗传多样性 分子身份证 聚类分析
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 农业生物基因
• 页码范围: 221-228
• 页数: 8页
• 分类号: S565.102
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2020.12.023

摘要

[目的]对广东省大豆资源进行遗传多样性分析,筛选有效的SSR分子标记,以及构建快速鉴定的DNA分子身份证.[方法]收集了广东省19个市37个县市共96份大豆种质资源,提取基因组DNA后,利用30对SSR引物进行PCR扩增,通过测序检测获得相关多态性结果进行聚类分析以及DNA分子身份证构建,记录相关品种性状并转化为可视化信息.[结果]毛细管电泳检测结果表明,30对SSR引物在96份大豆材料之间均具有清晰稳定的多态性片段,共扩增出273个多态性等位变异片段,平均每对引物扩增出多态性等位变异片段数14.29个;不同引物揭示的多态性信息含量(PIC)的范围为0.3891～0.9310,平均值为0.6786,30对引物可用于区分广东大豆资源.通过聚类分析发现,所收集的大豆样品可以分为3个类群,具有遗传多样性.从PIC最高者开始进行引物组合,筛选出6对能将96份大豆区分开的引物.[结论]基于6对SSR引物扩增结果,对多态性片段排序,通过数字与英文结合编码,成功构建96份大豆资源的DNA分子身份证,为广东省大豆种质资源鉴定提供了重要依据.