甜瓜短蔓基因Cmdm1的精细定位及候选基因分析

• 作者: 李丛丛 王建设 马建
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 甜瓜 短蔓 基因定位 Cmdm1 ERECTA
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 802-810
• 页数: 9页
• 字数: 6171字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2020.04.012

摘要

[目的]对甜瓜短蔓突变体Z8进行短蔓基因的精细定位并确定候选基因,为甜瓜株型的分子改良奠定基础.[方法]考察短蔓突变体Z8和野生型B15的主蔓节数、主蔓长度、主蔓节间长度以及侧枝长度等农艺性状.配制Z8/B15杂交组合并进行遗传分析,利用F2群体中的短蔓单株进行基因精细定位.通过对定位区间内注释基因编码区进行测序以确定候选基因.[结果]与野生型B15相比,突变体Z8节间显著变短导致植株矮化,顶端花序紧凑簇生,遗传分析表明其短蔓性状由一对隐性核基因Cmdm1控制.采用基因图位克隆策略,利用780个F2短蔓单株最终将该基因精细定位于第7染色体短臂标记c7-112和s2之间约56 kb的区间内,并与标记dm-1共分离,区间内共包含4个注释基因.经测序鉴定,发现Z8中与拟南芥ERECTA同源的MELO3C016916 ATG下游第1995位碱基由T突变为G而产生终止密码子,导致蛋白翻译提前终止,致使后面激酶结构域完全缺失,推测MELO3C016916即为控制蔓长的Cmdm1.[结论]Z8短蔓性状受隐性核基因Cmdm1控制,利用分子标记最终将该基因定位于7号染色体短臂标记c7-112和s2之间约56 kb区间内,推测MELO3C016916为最有可能的候选基因.