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灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
作者:
付强强
徐广飞
沈彦辉
陈宏坤
高璐阳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
灰葡萄孢
Bctre1
基因组定位
蛋白结构
表达分析
摘要:
本研究选取灰葡萄孢菌株BC 05.10为试材,克隆Bctre1基因的核苷酸序列并对其进行生物信息学分析,同时采用荧光定量PCR法研究该基因在不同侵染时期、分生孢子萌发过程中以及不同碳源、海藻糖诱导下的表达情况.结果表明:该基因ID号为5428296,全长3341 bp,位于scaffold 17负链的495880~499211位置,与核盘菌Sstre1的同源关系较近;BcTRE1蛋白由1033个氨基酸残基编码组成,该蛋白N端具有2个6发卡结构的超糖苷酶家族和1个C端糖基水解酶家族63.荧光定量PCR结果显示,随着侵染时间的延长Bctre1表达量显著增加(P<0.05),48 h后表达量增加不显著;Bctre1在分生孢子萌发24 h时表达量最高;Bctre1在海藻糖为单一碳源的培养基中表达量最高,在海藻糖诱导下12 h后Bctre1表达量显著增加(P<0.05).综上,Bctre1与侵染寄主过程中分生孢子萌发及不同碳源利用密切相关,在侵染后期对促进菌丝生长发挥重要作用.
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文献信息
篇名
灰葡萄孢Bctre1的基因组定位、蛋白质结构预测及表达分析
来源期刊
山东农业科学
学科
农学
关键词
灰葡萄孢
Bctre1
基因组定位
蛋白结构
表达分析
年,卷(期)
2020,(3)
所属期刊栏目
生物技术·遗传育种·种质资源
研究方向
页码范围
13-18
页数
6页
分类号
S432.4+4|Q78
字数
4121字
语种
中文
DOI
10.14083/j.issn.1001-4942.2020.03.003
五维指标
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引文网络
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Bctre1
基因组定位
蛋白结构
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研究分支
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山东农业科学
主办单位:
山东省农业科学院
山东农学会
山东农业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-4942
CN:
37-1148/S
开本:
大16开
出版地:
济南市工业北路202号
邮发代号:
24-2
创刊时间:
1963
语种:
chi
出版文献量(篇)
7549
总下载数(次)
16
总被引数(次)
44865
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