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不同纤维源日粮下东北梅花鹿瘤胃微生物功能基因的宏基因组分析
不同纤维源日粮下东北梅花鹿瘤胃微生物功能基因的宏基因组分析
作者:
丛立新
刘国文
张辉
赵晨旭
魏园
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
东北梅花鹿
瘤胃微生物
玉米秸叶
柞树叶
功能基因
摘要:
为了研究不同粗纤维源日粮对梅花鹿瘤胃微生物区系的影响,选择10头健康公鹿分成JG、ZS 2组,每组5头,分别以玉米秸叶和柞树叶作为粗纤维源,试验时期为2个月,提取梅花鹿瘤胃液中微生物总基因,构建文库并测序及基因功能注释分析.结果 表明:JG和ZS 2组样本的总碱基数量和总序列数量分别为11150909160和12540742633、75018396和84518090.在JG和ZS 2组样品中约1/2以上的纤维素糖苷水解酶(glycoside hydrolases,GHs)来自于瘤胃球菌属(Ruminococcus)(JG和ZS 2组样品分别为52.79%和51.07%)和纤维杆菌属(Fibrobacter)(JG和ZS 2组样品分别为14.22%和15.49%).而很大一部分半纤维素酶由Ruminococcus(分别为39.20和37.55%)、普雷沃菌属(Prevotella)(分别为22.68%和20.66%)、Fibrobacter(8.86%,9.48%)、梭状芽孢杆菌属(Clostridium)(2.27%,1.94%)分泌.此外,共有24个GHs家族参与植物细胞壁多糖的降解,其中GH5、GH9、GH45和GH48为降解纤维素的优势酶类,GH8、GH10、GH11、GH26、GH28、GH51、GH53、GH78对于半纤维素降解起重要作用,而对于寡糖降解起主要作用的有GH1、GH2、GH3、GH43和GH94.结论:当饲喂粗纤维较多玉米叶时,以降解纤维素为主的纤维降解酶的比例升高,而寡糖降解酶在瘤胃中的比例降低;当饲喂含丰富可发酵碳水化合物的柞树叶时,结果相反.
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文献信息
篇名
不同纤维源日粮下东北梅花鹿瘤胃微生物功能基因的宏基因组分析
来源期刊
中国兽医学报
学科
农学
关键词
东北梅花鹿
瘤胃微生物
玉米秸叶
柞树叶
功能基因
年,卷(期)
2020,(7)
所属期刊栏目
临床兽医学
研究方向
页码范围
1391-1396
页数
6页
分类号
S852
字数
语种
中文
DOI
10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.07.22
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘国文
吉林大学动物医学学院
134
438
10.0
13.0
2
张辉
吉林农业科技学院动物科技学院
70
276
8.0
14.0
3
丛立新
吉林农业科技学院动物科技学院
16
38
4.0
5.0
4
魏园
吉林农业科技学院动物科技学院
2
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赵晨旭
吉林大学动物医学学院
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瘤胃微生物
玉米秸叶
柞树叶
功能基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
中国兽医学报
主办单位:
吉林大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1005-4545
CN:
22-1234/R
开本:
大16开
出版地:
长春市西安大路5333号
邮发代号:
12-105
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
7291
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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