OCX-32基因内含子变异对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响

• 作者: 吴磊 张依裕 李杰章 田琴 覃媛钰 谭光辉
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 长顺绿壳蛋鸡 OCX-32基因 SNP 内含子 荧光定量PCR 蛋壳品质
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 专题:鸡
• 页码范围: 1872-1879
• 页数: 8页
• 分类号: S831.91
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1191.2020.08.011

摘要

[目的]探讨OCX-32基因对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的遗传效应,为长顺绿壳蛋鸡的保种选育及开发利用提供参考依据.[方法]以长顺绿壳蛋鸡为材料,采用PCR产物直接测序法筛选OCX-32基因SNP多态位点,实时荧光定量PCR检测组织表达谱,运用SPSS 19.0广义线性模型(GLM)分析SNP位点基因型或双倍型与所测定性状指标的相关性.[结果]在长顺绿壳蛋鸡OCX-32基因中检测到3个SNPs位点,分别是位于内含子1上的g.22592323G>T及内含子3上的g.22597350T>C和g.22597555G>A.卡方(χ2)检测结果发现,g.22597350T>C位点的基因型分布显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05,下同).连锁不平衡分析结果显示,3个SNPs突变位点不存在强连锁不平衡,共发现4种单倍型和8种双倍型,单倍型H1和双倍型H1H2频率最高,分别为0.523和0.345.实时荧光定量PCR检测结果显示,OCX-32基因在长顺绿壳蛋鸡12个组织中存在不同程度的表达,表达量排序为肾脏>心脏>子宫>腹脂>小肠>脾脏>肝脏>腺胃>胸肌>胰腺>肺脏>肌胃.关联分析结果显示,g.22597350T>C位点CC基因型在蛋壳强度和蛋壳重2个品质指标上显著高于CT基因型和TT基因型;双倍型H4H4个体的蛋壳强度显著高于其他7种双倍型个体,蛋壳重显著高于H2H4个体.[结论]OCX-32基因内含子变异能影响长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质,检测到的3个SNPs位点可作为鸡蛋壳品质选择的遗传分子标记,其中突变位点g.22597350T>C的CC基因型和双倍型H4H4是影响蛋壳强度和蛋壳重的关键基因型和双倍型,有利改善蛋壳品质.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	田琴		22	104	6.0	10.0
2	张依裕		89	243	7.0	8.0
3	吴磊		20	13	2.0	3.0
4	覃媛钰		11	9	2.0	3.0
5	谭光辉		6	0	0.0	0.0
6	李杰章		7	0	0.0	0.0