长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR 结构域的多态性对蛋壳品质的影响

• 作者: 刘若余 吴磊 廖朝美 张依裕 李杰章 游敏芳 谭光辉
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 长顺绿壳蛋鸡 ITPR1基因 SNP RYDR-ITPR结构域 蛋壳品质
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 124-129
• 页数: 6页
• 分类号: S831.2
• 字数: 3996字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.08.015

摘要

为了探究贵州特产长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域的多态性对蛋壳品质的影响,采用在线引物设计软件Primer Premier 3.0设计1对引物,扩增ITPR1基因RYDR-ITPR结构域,利用双向直接测序和序列比对法挖掘单核苷酸多态性(SNP)位点,应用SPSS 18.0软件分析SNP位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响.结果显示,在ITPR1基因第17～19内含子区共发现3个SNP位点,分别为位于18内含子上的g.18853584 G>T、g.18853600 A>G突变位点和19外显子上的g.18853848 C>T突变位点;3个SNP位点均为中度多态,均未偏离Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),共检测到4种单倍型和7种双倍型.关联分析结果显示,位于19外显子上的g.18853848 C>T突变对蛋壳厚度有显著影响,TT、CC基因型显著高于TC基因型(P<0.05);双倍型H3H3的蛋壳厚度和蛋壳强度测定值最高.综上,长顺绿壳蛋鸡ITPR1基因RYDR-ITPR结构域中g.18853848 C>T突变可能是影响蛋壳厚度的标记位点,双倍型H3H3可能是蛋壳厚度和蛋壳强度的有利双倍型.