玫瑰茄转录组测序及花青素合成相关基因表达分析

• 作者: 姚运法 张少平 林碧珍 洪建基 练冬梅 赖正锋
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玫瑰茄 花瓣 花萼 转录组 花青素 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 41-45
• 页数: 5页
• 分类号: Q786|S681.901
• 字数: 4136字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2020.06.008

摘要

以玫瑰茄(Hibiscus sabdariffa Linnaeus)花瓣和花萼为研究对象,采用Illumina HiseqTM 2500高通量测序技术,对花瓣和花萼进行转录组测序及花青素合成相关基因差异表达分析.结果表明,花瓣和花萼共获得13.94 Gb有效数据(clean data),Q30碱基百分比均达到93.0％以上;共获得1399个差异表达基因(DEGs),包括65个上调基因,1334个下调基因,且功能注释的基因有1176个;筛选出了与花青素合成相关结构基因CHI、FLS、ANR、CHI在花萼中表达显著,FLS、ANR在花瓣中表达显著.本研究丰富了花青素相关研究,可为阐明玫瑰茄花青素合成机制提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖正锋	福建省农业科学院亚热带农业研究所	89	220	7.0	9.0
2	洪建基	福建省农业科学院亚热带农业研究所	96	314	10.0	13.0
3	张少平	福建省农业科学院亚热带农业研究所	91	247	8.0	10.0
4	姚运法	福建省农业科学院亚热带农业研究所	57	123	6.0	8.0
5	练冬梅	福建省农业科学院亚热带农业研究所	37	52	4.0	5.0
6	林碧珍	福建省农业科学院亚热带农业研究所	21	28	3.0	4.0